Seguidamente pulsas en el directorio de tu foro (no entres, simplemente para que se quede sombreado) en el marco izquierdo.
Con el puntero del ratón encima de ese directorio pulsas el botón derecho del ratón y te saldrá un pequeño menú en donde deberás hacer clic en "Subir". Así:

Ya solo queda tener paciencia, porque tardará un rato en subir los cientos de archivos que componen el phpBB3.