Bueno, permiso para contestarme a mí mismo: 
La línea desaparece de esta forma: 
En jumpbox.tpl
Código: Seleccionar todo
<form method="get" name="jumpbox" action="{S_JUMPBOX_ACTION}" onSubmit="if(document.jumpbox.f.value == -1){return false;}">
<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0">
	<tr> 
		<td nowrap="nowrap">
			<span class="gensmall">{L_JUMP_TO}: {S_JUMPBOX_SELECT} <input type="submit" value="{L_GO}" class="liteoption" /></span>
		</td>
	</tr>
</table>
</form>
Cambié la posición de <form> </form> poniéndolo dentro de <table> y antes de <td>: 
Código: Seleccionar todo
<table valign="bottom" cellspacing="0" cellpadding="0" height="25" border="0">
	<tr> 
		<form method="get" name="jumpbox" action="{S_JUMPBOX_ACTION}" onSubmit="if(document.jumpbox.f.value == -1){return false;}">
		<td align="center" valign="middle" nowrap="nowrap">
			<span class="gensmall">{L_JUMP_TO}: {S_JUMPBOX_SELECT} <input type="submit" value="{L_GO}" class="liteoption" /></span>
		</td>
		</form>
	</tr>
</table>
Caso curioso para mí que con el cambio de posición, la línea desaparece. 
Gracias de todas formas por el lugar para soporte. 
 
