Hola que tal tenía rato que no venia por estos lares, estaba estudiando php y bueno aun sigo

ahora he visto que ya pasaron dos actualizaciones la 3.0.6 y la 3.0.7 quiero actualizarlas pero tengo mods, y con el paquete que dan para ese tipo de actualizacion o no me descarga bien los archivos, o no esto o no lo otro entonces he decidido quitar los mods, algunos son innecesarios y otros no los he usado, y los que si pues bueno son faciles de implementar o ya veremos,
entonces depsués de todo el rollo, quiero preguntarles algo, si actualizo con el paquete que se usa para los foros si n mods tndré problemas? o solo borrara los mods, (es lo que me vendría de lujo) por que no quiero quitar mod por mod, y asi solo borraria las tablas de la BD y volvería a poner solo los mods que quiero, bueno esa es mi duda espero alguien pueda despejarla. gracias.