Las extensiones no tocaran código alguno del "core" de phpBB, y se instalaran con un solo clic, eso hará que sea IMPOSIBLE que un usuario o Administrador de un foro en este caso, "meta la pata" editando código al instalar un MOD/Extensión, y por lo tanto se evitaran errores de instalación o actualización de una Extensión. Cuando esa Extensión quiera ser desinstalada, con un solo clic también lo conseguiremos, y repito, no habrá una sola línea en el código "core" del foro.
Lo malo, que si lo hay, es que veo que phpBB 3.1 "pesa más", y le cuesta bastante más cargar, al menos eso veo en un foro de pruebas, a ver si sigo con el tema de pasar una copia de este foro a 3.1 (que no sea localhost) porque lo que quiero es hacer una prueba con varios usuarios conectados a la vez, y ver como se comporta.
Con el tema de las Extensiones, usaran rutas virtuales para ser instaladas, osea, no tocaran archivos "físicamente" pero si virtualmente, quienes usen o hayan usado phpBB-SEO sabrán a que me refiero, por ejemplo en este servidor o foro, no existe la ruta:
http://www.phpbb-es.com/foro/usuario/merlet/
Pero si haces clic te lleva a tu Perfil, eso es gracias a las rutas virtuales.
Sobre que habrá MODs que echaremos de menos, seguro, eso tenemos que tenerlo en mente, pero en el foro de desarrollo de Extensiones veo un buen trabajo por ahora, pequeño número de Extensiones comparado con el número de MODs existente, pero también hay un montón de MODs que no los actualiza su autor desde el 2010, 2011, 2012, etc. los MODs actualizados a las últimas fechas no son tantos, con lo cual yo personalmente prefiero un desarrollo constante y soporte efectivo, que un MOD/Extensión "chulo" del año 2012 que lleva 2 años validado oficialmente, pero que su autor no contesta a preguntas de soporte desde hace un año (por poner un ejemplo).
Saludos.